ZipGenius supporta oltre 20 tipi di archivi. Alcuni di essi possono essere usati sia per la compressione che per la decompressione dei file, mentre altri sono supportati solo in decompressione.
Alcuni formati richiedono uno strumento esterno: ciò significa che ZipGenius non può gestire quei tipi di file direttamente ma bisogna scaricare questi strumenti da altre fonti.
| Tipo di file | Richiede strumento esterno? | Estrazione | Compressione |
| ZIP, CZIP, EXE (ZIP SFX) | No | SÌ! | SÌ! |
| JAR, EAR, WAR (Java Archive) | No | SÌ! | SÌ! |
| RAR, R**, EXE (RAR SFX), CBR | No | SÌ! | NO! |
| TAR, TAR.GZ, TAR.BZ2, TAZ, TGZ | No | SÌ! | SÌ ma non può aggiornare gli archivi |
| ISO, NRG, CMI | No | SÌ! | NO! |
| Documenti OpenOffice / LibreOffice (OD*) | No | SÌ! | SÌ! |
| CAB | No | SÌ! | SÌ ma non può aggiornare gli archivi |
| RPM | No | SÌ! | SÌ ma non può aggiornare gli archivi |
| DSFZ, BSZ, MSKIN, CBZ, PCV | No | SÌ! | SÌ! |
| XPI – Estensione Firefox | No | SÌ! | SÌ! |
| Documenti OpenOffice.org 1.x | No | SÌ! | SÌ! |
| ACE, EXE (ACE SFX) | No | SÌ! | NO! |
| ARJ | SÌ! | SÌ! | NO! |
| LZH, LHA | SÌ! | SÌ! | SÌ! |
| SQX, YZ1, WAL, WMZ | No | SÌ! | SÌ! |
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